以前UniprotからFastaを取ってくる方法の記事を書いた。UniprotではURLを適宜いじることでFastaを直接ダウンロードできたが, NCBIで同様の方法は使えない（ようだ）。 具体的にはBiopythonのEntrezを使う。詳細は以下参照。 https://www.biostars.org/p/1771…

やりたいこと Uniprotから任意のアミノ酸配列をFASTA形式でPythonなどのプログラミング言語を使うことにより自動取得したい。 参考 以下のサイトでまずUniprotとは何かを理解した。アミノ酸配列とその機能情報を掲載しているらしい。 magattaca.hatenablog.c…

目的 仕事でホモロジーモデリングをする必要が出てきた。それにはhhsuiteなるものが必要らしい。よくわからないので入力／出力および特性を理解する。アルゴの詳細には深入りしない。 同じようなソフトウェアは他にも有るはずなので, それらのソフトウェアと…